在確定每一塊水田和旱田的等級，記載其實際長寬（十二間、三十六間等）和面積，然后乘上斗代，算出每塊地的石高（分米，即收繳額），最下面記載所有者姓名。

    在賬面的最后按等級計算出面積和石高，然后再算出該村田地和宅地的合計面積以及村的總石高。

    將寫有以上內容的檢地賬交由村民進行抄寫，并讓他們提交承認其內容的字據，這樣事后就不會有人對面積和斗代提出異議。

    檢地奉行和奉行人、代官等在這份抄寫本的檢地賬上蓋章，然后交給村民保管。以上種種，都是檢地奉行、奉行人、代官等人的任務。

    這樣就形成了一座領主階級的金字塔：以家督上條清定為頂點，其下分列著家臣、陪臣（家臣的家臣），是一種多層的主從關系。

    而這種主從關系得以成立的關鍵在于根據石高分封領知（恩賞）以及受封者的奉公（兵役），因此，石高是確定領主階級主從秩序所必需的工具，實行檢地正是為了把握石高。

    既然運用檢地規定的標準來統一長度和容積，并據此計算石高，那么比如說一萬石的領知額，從原則上來說，不論在刈羽郡還是在其他地區都應該是一樣的。所以清定只要通過計算石高，就可以把大名轉封到任一地區。比如說，按照相同的標準，凡一萬石的大名需要承擔五百人的兵役。還可以據此建立起一個統一的大名門第及排序的體系。同樣的事也發生在各大名領的大名及其家臣之間。通過建立起這樣的制度，統一政權就能成為一種超越的、專制的權力。

    但是，檢地并非由奉行人、代官擅自實行，而是他們需要先接觸村落，讓村中的代表人物作為向導，然后才能進行。

    如果沒有村民，上條家的檢地奉行、奉行人、代官是不可能知道村落的分界、田地的等級和田地名請人姓名的。當然，決定等級的時候，檢地奉行、奉行人、代官若根據日照和水利情況希望將其定為上等，就會和村民產生矛盾，但這也說明村民可以在檢地現場表達自己的主張。

    雖說領主與百姓的身份區別很大，百姓的主張也有可能不被接受，但總的來說檢地賬是經由雙方利益碰撞后定下來的，所以村民也對檢地賬的內容負有責任。檢地的奉行人、代官蓋章后將檢地賬交給村落，此時百姓提交證書，就表示承認檢地內容，尤其是其中的村高，也意味著本村承包了年貢的繳納。

    年貢額一般以村高為基準，再乘以幾成、幾分這樣的年貢率，以村為單位計算，針對村落征收年貢。村吏（特別是莊屋、名主）以此為基準，根據每一個村民的承擔額分別征收，集齊全村的年貢額之后再上繳給領主。如果有不能繳納（未進）的百姓，莊屋等人可以墊付，總之要備齊全村的年貢額后再一次性上繳。這就是年貢的“村請”。因為村落承擔責任，所以村的石高非常重要。

    那么，像這樣通過給予所領（土地）來確立領主階級（武士身份）內部的主從關系、領主與農民（百姓）之間的統治與被統治的階級（身份）關系的制度，就被稱作知行制，不過，狹義上用作前者即主從關系的場合比較多。另外，以這種關系為中心形成的社會被稱作封建社會。清定以石高為基準構建起知行制，并從刈羽郡開始推廣至上條家治下的領國，建成了統一的石高制為基礎的知行制。

    由于上條家在統治從敵方手中奪取的領地和一些無主之地時，基本上是讓當地的領民自行上報（百姓指出），并以此為依據掌握原領主的所領范圍和征收年貢、徭役等等。而像寺院、神社等擁有領土之人，則是以石高申報各自的知行額（領主指出）。

    不過，也有一些例外。

    根據申報，與上條家有淵源的刈羽郡鵜川莊實相寺領的當知行額（該收繳的年貢等）為一千一百石，但清定卻以實相寺中供奉著上條定憲、上條彌五郎以及諸多上條一族之人的牌位為由，直接給予實相寺‘不輸（不納賦稅的權利）’的特權。

    米山寺因捐出大量典籍用于鄉中教育，其當知行額兩千石被清定免除兩年。

    而被清定授予苗字帶刀特權的山口村、巖原村、劍野村、泉田村、大月村這五座村子則是享有四公六民（四成上繳主家，六成農民自留）以及不用承擔任何勞役的優惠政策，倘若遇到收成不好的年份還會再往下進行減稅或者免除當年的年貢。

    當然，“指出”的內容和格式都有明確規定。